1938 à 1945 : Création de la SNCF Grand brassage du matériel qui conserve les couleurs des anciens réseaux.
- Le 1er janvier 1938 création effective de la SNCF. Pierre Guinand est nommé président.
- Le 12 novembre 1938 instauration du Comité des transports parisiens, dirigé par l'État.
- 1938 Le 1er janvier, nationalisation des chemins de fer et création de la SNCF, avec le statut d’une société d’économie mixte dans laquelle l’État détenait la majorité. Les concessions et les actifs (à l'exception du domaine privé) sont transférés à la société nouvellement créée. Pierre Guinand est nommé comme premier président de la SNCF.
- Le 9 mars 1939 naissance à Belfort de Jean-Pierre Chevènement. homme politique français. Ministre de l'Intérieur de 1997 à 2000.
- Le 19 mars 1939 la ligne Clamecy - Cercy-la-Tour et la section Clamecy - Nevers de la ligne Auxerre - Nevers sont mis en affermage à la SGCFE par la SNCF.
- Le 3 septembre 1939 fin de l'exploitation du train Flèche d'or.
- En 1940 fermeture de la section Villebois - Montalieu-Vercieu de la ligne Ambérieux - Montalieu.
- Le 11 septembre 1940 Pierre-Eugène Fournier remplace Pierre Guinand, démis de ses fonctions par le gouvernement de Vichy, à la présidence de la SNCF.
- 1940 Le 1er juillet, la Reichsbahn commence l'exploitation directe du réseau Alsace Lorraine.
- 1940 Le 15 août, application des tarifs allemands sur le réseau Alsace-Lorraine, annexé de fait par la Reichsbahn.
- 1940 En Août, l'exploitation du réseau en zone occupée, hors Alsace-Lorraine est transférée dans son ensemble à la WVD (Wehrmacht Verkehrs Direktion) installée à Paris. À cette fin, les Allemands mettent en place, dans les ateliers et les gares importantes, du personnel allemand chargé de surveiller les cheminots. Une WVD est également installée à Bruxelles, qui a compétence sur une partie du Nord de la France.
- 1940 Le 11 septembre, Pierre-Eugène Fournier, ancien gouverneur de la Banque de France, est nommé président du Conseil d'administration de la SNCF.
- 1940 Le 11 décembre, Décret portant organisation du contrôle de l'Etat sur les chemins de fer et les transports par route et par eau de la métropole.
- En 1941 fermeture de la section Saint-Cannat - La Calade - Eguilles de la ligne Salon - Aix.
- Le 30 novembre 1941 fermeture de la section Grézieux-le-Fromental - Montbrison de la ligne Lyon - Montbrison.
- En 1942 fermeture de la section Épinac-les-Mines - Ivry-Cussy de la ligne Épinac - canal de Bourgogne.
- Le 6 octobre 1942 fusion des stations Marbeuf et Rond-Point des Champs-Élysées pour donner Marbeuf – Rond-Point des Champs-Elysées.
- En 1943 suppression de la seconde voie de la ligne Sathonay - Bourg.
- En 1944 fermeture de la section Trinquetaille - Arles de la ligne Lunel - Arles.
- Le 26 janvier 1944 naissance à Montauban de Louis Gallois. Haut fonctionnaire et dirigeant d'entreprise français. Il est président de la SNCF entre juillet 1996 et juillet 2006.
- En 1945 fermeture de la section Gallargues - Sommières de la ligne Lunel - Le Vigan.
- Le 11 août 1945 naissance à Lyon de Dominique Perben. Homme politique français. Ministre des transports.